Zeytinburnu Mensucat Santral Anadolu Lisesi'nin eski halinde olduğu dönemlerde yani ilköğretim iken orada okumuş oradan Şehremini Lisesi'ne geçmiştir.
Zeytinburnu'nda oynarken parladı ve Galatasaray ile Fenerbahçe onu transfer etmek için rekabete girdi. 1996/1997 sezonunda daha 16 yaşındayken Galatasaray'da kadroya girmeye başlamıştır. Her sezon biraz daha kendini göstererek A takımın ilk 11'inde yer buldu. Bu dönemde teknik direktörü Fatih Terim ile örnek aldığı takım arkadaşı Gheorghe Hagi sayesinde kendini çok geliştirdi. Takımının 4 sene üst üste şampiyon olmasında ve 2000 yılında UEFA Kupası'nı almasında büyük rol aldı.
2002 Dünya Kupası'nda 3. olan Türk Millî Futbol Takımı kadrosunda yer aldı. Mart 2004'de, Pele tarafından yaşayan en büyük 125 oyuncu arasında gösterildi.
14 Haziran 2005'de 3.8 milyon Avro transfer ücretiyle Inter Milan'dan Newcastle United'a transfer oldu.
Fenerbahçe SK, 31 Mayıs 2008'de yaptığı açıklamada, Newcastle United'la 2 yıllık sözleşmesi bulunan Emre Belözoğlu ile anlaşma sağladığını açıkladı.[1] Emre Belözoğlu, 2008 UEFA Avrupa Futbol Şampiyonası'nın ardından Türk Silahlı Kuvvetleri'ne başvurarak bedelli askerlik yaptı. 23 Temmuz 2008 günü Fenerbahçe Şükrü Saracoğlu Stadyumu'nda düzenlenen törende Belözoğlu kendisini Fenerbahçe SK'ye bağlayan anlaşmayı imzaladı ve burada giyeceği 5 numaralı formayla tanıtım yaptı.
Başarıları Galatasaray UEFA Süper Kupası: 1 (2000) UEFA Kupası: 1 (2000) 1. Lig Şampiyonluğu: 4 (1996–97, 1997–98, 1998–99, 1999–2000) Türkiye Kupası: 3 (1996, 1999, 2000) Türkiye 2002 FIFA Dünya Kupası: 3.lük 2008 UEFA Avrupa Şampiyonası: 3.lük İnter Milan İtalya Kupası: 1 (2005) Newcastle United UEFA İntertoto Kupası: 1 (2006)